С помощью суперкомпьютера Q machine сотрудники Национальной лаборатории в Лос-Аламосе смогли в анимации воспроизвести процесс, в котором рибосома - один из самых загадочных элементов живой клетки - «строит» молекулу белка из атомов. В модели было задействовано в общей сложности 2 миллиона 640 тысяч атомов, что более чем в 6 раз превосходит масштабы предыдущей аналогичной компьютерной модели, передает ИТАР-ТАСС.
Как пояснил Кевин Санбонматсу, молекулярный биолог и ведущий этого проекта, рибосомы - своеобразный фундамент жизни. Они своего рода посредники в передаче информации, хранящейся в ДНК, белкам. Считается, что они «самое древнейшее свидетельство, дошедшее до нас с момента зарождения жизни, которое мы можем сегодня изучать», уверен микробиолог.
Для того, чтобы смоделировать процесс строительства белка в действии, суперкомпьютеру, работающему на 9 тысяч процессоров, понадобилось 260 дней непрерывной работы, пишет CNet. До сих пор ученые довольствовались снимками со сверхмалой выдержкой, которые лишь выхватывали фрагменты процесса. Дело в том, что работа рибосомы, стимулирующей создание белка, занимает всего 2 наносекунды, или 2 миллиардных секунды - слишком мало, чтобы даже считать это «мигом».
Анимационный фильм, состоящий из 20 миллионов «кадров», может оказаться полезным фармакологам, прежде всего для создания новых антибиотиков. Последние в организме человека взаимодействуют с рибосомами, и фильм демонстрирует механизм их работы гораздо подробнее, чем это видно на картинках.
24.10.2005
По материалам: NEWSru
По материалам: NEWSru
Фото: Los Alamos National Laboratory
